Постоянной экспозиции не имеет, работает в режиме передвижных и временных выставок. Базовая передвижная выставка «В мире двух диктатур. Россия и Германия в ХХ веке». Экспонировалась в помещении центра (2000-2003), Воронеже (2001), Сыктывкаре (2002), Глазго (2003), Риге (2004). В экспозиции представлены документы и материалы из архива НИЦ, государственных и частных архивов, личные вещи бывших заключенных, предметы лагерного быта.
С 1994 года центр провел более 20 тематических временных выставок, среди них: «Мир Гулага» (1994, 1996, 1998), «Кемь - преддверье Соловков» (1995), «Меньшевики в советской России» (1995), «По обе стороны тюремной двери: Искусство Гулага» (1995), «Возле тюрем своих» (1997), «60 лет "большого террора"» (1997), «Самиздат» (2001), «Будапешт-Ленинград, 1956» (2001), «Из истории ОКБ-172» (2001), «Воркута-Ленинград: История сопротивления в зеркале Коми в 50-х - 80-х годах» (Сыктывкар-Санкт-Петербург, 2003) и др.
Основу коллекции составляют: биографические фонды (2868 дел - личные документы, письма, дневники - подлинники и копии), фотоархив (около 10 000 ед. хр.), фонд воспоминаний (более 200 ед. хр), предметный фонд (около 600 ед. хр.) и др. Выделены тематические фонды, в том числе: «Самиздат», «Меньшевики после 1917 года», «Политзаключенные 1950-х - 1980-х годов», «Соловецкий лагерь» и др., а также архив программы Устной истории.
НИЦ «Мемориал» регулярно проводит научные конференции и культурно-просветительные мероприятия, в частности ежегодные чтения памяти В.В.Иофе, ведет издательскую деятельность. В центре проводятся лекции, дискуссии, круглые столы, показ документальных фильмов, правовые и научные консультации.